Παρακολούθηση
Πρέπει να διενεργείται παρακολούθηση, τα δε κράτη μέλη οφείλουν να παρέχουν στην Επιτροπή όλες τις σχετικές πληροφορίες σχετικά με τη μέθοδο παρακολούθησης που χρησιμοποιείται. Εικοσιτετράωρα δείγματα ανάλογα προς τη ροή ή βασισμένα στη χρονική διάρκεια συλλέγονται «στο ίδιο, σαφώς καθορισμένο σημείο της εξόδου και, εφόσον χρειάζεται, της εισόδου του σταθμού επεξεργασίας, ώστε να ελέγχεται κατά πόσον τα εξερχόμενα λύματα πληρούν τις απαιτήσεις απόρριψης που ορίζονται στην παρούσα οδηγία.» Ο ελάχιστος ετήσιος αριθμός δειγμάτων καθορίζεται ανάλογα με το μέγεθος της μονάδας επεξεργασίας και συλλέγεται σε τακτά χρονικά διαστήματα κατά τη διάρκεια του έτους, σύμφωνα με πίνακα και ανάλογα με το επίπεδο του ι.π. (παράρτημα I-Δ). Σύμφωνα με το Δικαστήριο, ενώ οι εν λόγω διατάξεις αναφέρονται σε «μια συνεχή υποχρέωση με την οποία επιδιώκεται να διασφαλιστεί ότι οι απορρίψεις συμμορφώνονται ‘διαρκώς’ προς τις απαιτήσεις ποιότητας που έπρεπε να πληρούνται από τη θέση σε λειτουργία του σταθμού», δεν απαιτούν τη συλλογή δειγμάτων ολόκληρο το έτος και «εφόσον κράτος μέλος είναι σε θέση να υποβάλει ένα δείγμα που να ανταποκρίνεται στις προβλεπόμενες στο παράρτημα I, σημείο B, της οδηγίας 91/271 απαιτήσεις, πρέπει να θεωρείται ότι πληρούνται οι υποχρεώσεις που απορρέουν από το άρθρο 4 της οδηγίας αυτής.» (Υπόθεση C-398/14 Επιτροπή κατά Πορτογαλίας).
Η απόρριψη βιομηχανικών λυμάτων στα αποχετευτικά δίκτυα και στους σταθμούς επεξεργασίας αστικών λυμάτων υπόκειται σε κανόνες και/ή στην παροχή ειδικών αδειών σύμφωνα με περαιτέρω απαιτήσεις (άρθρο 11). Πρέπει κυρίως να υποβάλλονται σε εκ των προτέρων επεξεργασία ώστε να προστατεύεται η υγεία του προσωπικού που εργάζεται σε αποχετευτικά δίκτυα και σταθμούς επεξεργασίας και να διασφαλίζεται ότι τα αποχετευτικά δίκτυα, οι σταθμοί επεξεργασίας λυμάτων και ο συναφής εξοπλισμός δεν έχουν υποστεί ζημιές, ότι δεν παρεμποδίζονται η λειτουργία του σταθμού επεξεργασίας λυμάτων και η επεξεργασία της λυματολάσπης, ότι οι απορρίψεις από τους σταθμούς επεξεργασίας δεν επηρεάζουν δυσμενώς το περιβάλλον, ούτε αποτρέπουν τη συμμόρφωση των υδάτων υποδοχής με άλλες οδηγίες της ΕΕ, καθώς και ότι η λυματολάσπη μπορεί να απορριφθεί με ασφάλεια κατά τρόπο περιβαλλοντικά αποδεκτό (παράρτημα Ι στοιχείο γ)). Τα βιοαποικοδομήσιμα βιομηχανικά λύματα που προέρχονται από ορισμένες βιομηχανίες επεξεργασίας τροφίμων πρέπει επίσης να πληρούν τους όρους που θεσπίζονται στα πλαίσια προηγούμενων κανόνων και/ή ειδικών αδειών βάσει ειδικών απαιτήσεων (άρθρο 13).